农村合作医疗的交费方式有：

1、参保人员持《新型农村合作医疗证》、《户口薄》到指定的地点办理参合登记;

2、参保人员前往乡镇新农合经办机构缴纳费用。

法律依据：

《中华人民共和国社会保险法》第二十四条

国家建立和完善新型农村合作医疗制度。

新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。

《中华人民共和国社会保险法》第二十五条

国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。

城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。

享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。